適用于單細(xì)胞RRBS測(cè)序的文庫(kù)建立方法及其應(yīng)用

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201710864035.3 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)(公告)號(hào) CN107475779A 公開(kāi)(公告)日 2017-12-15
申請(qǐng)公布號(hào) CN107475779A 申請(qǐng)公布日 2017-12-15
分類號(hào) C40B50/06(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I 分類 組合技術(shù)〔8〕;
發(fā)明人 李靜;陳昌岳;王芳;張祥林;胡秋萍;董東;鄭冠濤;段彪 申請(qǐng)(專利權(quán))人 上海美吉醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)有限公司
代理機(jī)構(gòu) 上海光華專利事務(wù)所(普通合伙) 代理人 上海美吉醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)有限公司
地址 200120 上海市浦東新區(qū)康新公路3399號(hào)3號(hào)樓5層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,具體公開(kāi)了一種適用于單細(xì)胞RRBS測(cè)序的文庫(kù)建立方法及其應(yīng)用。本發(fā)明公開(kāi)的適用于單細(xì)胞RRBS測(cè)序的文庫(kù)建立方法包括如下步驟:(1)對(duì)樣本的基因組DNA依次進(jìn)行酶切、末端補(bǔ)平和加A、加接頭以及重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化;(2)對(duì)步驟(1)中轉(zhuǎn)化后的基因組DNA進(jìn)行線性擴(kuò)增;(3)對(duì)步驟(2)中線性擴(kuò)增的擴(kuò)增子進(jìn)行指數(shù)擴(kuò)增,所述指數(shù)擴(kuò)增的擴(kuò)增子用作測(cè)序文庫(kù)。該方法測(cè)序所需的DNA起始量低,可以對(duì)單個(gè)細(xì)胞的基因組進(jìn)行甲基化測(cè)序;具有有效的文庫(kù)片段控制步驟,通過(guò)線性擴(kuò)增步驟控制最終產(chǎn)物的片段,避免繁復(fù)操作的同時(shí)提高覆蓋率。