基于全基因組重測序和KASP技術(shù)開發(fā)的煙草SNP標(biāo)記及其應(yīng)用

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202111086019.9 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN114507747A 公開（公告）日 2022-05-17
申請(qǐng)公布號(hào) CN114507747A 申請(qǐng)公布日 2022-05-17
分類號(hào) C12Q1/6895（2018.01）I;C12Q1/6858（2018.01）I;C12N15/11（2006.01）I;G16B30/20（2019.01）I;G16B30/10（2019.01）I;G16B20/20（2019.01）I;G06Q30/00（2012.01）I;G06K19/06（2006.01）I;G06K17/00（2006.01）I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 余世洲;楊志曉;陳勇;王豐;劉勝杰;雷波;任學(xué)良;余婧;趙會(huì)納;張劍鋒;金靜靜;王兵 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 貴州省煙草科學(xué)研究院
代理機(jī)構(gòu) 北京紀(jì)凱知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 -
地址 550081貴州省貴陽市觀山湖區(qū)龍灘壩路29號(hào)
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了基于全基因組重測序和KASP技術(shù)開發(fā)的煙草SNP標(biāo)記及其應(yīng)用。本發(fā)明基于150份煙草全基因組重測序數(shù)據(jù)，利用前期探索的數(shù)據(jù)分析方法，挖掘獲得了超過百萬個(gè)SNP位點(diǎn)，對(duì)這些位點(diǎn)進(jìn)一步分析，利用KASP技術(shù)平臺(tái)，鑒定篩選出240個(gè)核心SNP標(biāo)記及配套KASP引物，覆蓋了煙草24條染色體/連鎖群。本發(fā)明為煙草生物學(xué)研究提供了一套可信、便于后期利用的SNP標(biāo)記，這套SNP標(biāo)記和檢測引物，可用于煙草SNP檢測試劑盒開發(fā)、煙草品種DNA指紋圖譜構(gòu)建、煙草種質(zhì)資源和遺傳群體基因分型，煙草定向改良品種背景回復(fù)率檢測、煙草品種純度/真?zhèn)味葯z測、煙草分子標(biāo)記輔助選擇育種等。