一種基于Cycle-GAN的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法及裝置

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202011579598.6 申請日 -
公開(公告)號 CN112309497B 公開(公告)日 2021-04-02
申請公布號 CN112309497B 申請公布日 2021-04-02
分類號 G06N3/08(2006.01)I;G16B40/00(2019.01)I;G16B20/00(2019.01)I;G06N3/04(2006.01)I 分類 物理
發(fā)明人 華權(quán)高;趙海義;舒芹 申請(專利權(quán))人 武漢金開瑞生物工程有限公司
代理機構(gòu) 武漢藍寶石專利代理事務(wù)所(特殊普通合伙) 代理人 劉璐
地址 430000湖北省武漢市東湖開發(fā)區(qū)高新大道666號武漢國家生物產(chǎn)業(yè)基地項目B、C、D區(qū)研發(fā)樓B1樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及基于Cycle?GAN的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法及裝置,其方法包括:獲取多個蛋白質(zhì)的X射線晶體衍射圖像、核磁共振圖像和冷凍電鏡圖像,記X射線晶體衍射圖像為第一圖像、核磁共振圖像為第二圖像;根據(jù)第一圖像、第二圖像、核磁共振圖像構(gòu)建模型數(shù)據(jù)集;利用所述模型數(shù)據(jù)集對Cycle?GAN進行訓(xùn)練直至其損失函數(shù)值低于閾值停止訓(xùn)練;將待預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的第一圖像或第二圖像輸入到所述訓(xùn)練完成的Cycle?GAN,得到待預(yù)測蛋白質(zhì)的三維圖像。本發(fā)明利用Cycle?GAN對晶體衍射圖像、核磁共振圖像與冷凍電鏡圖像重建融合,得到冷凍電鏡圖像,在提高了分辨率的同時,降低了預(yù)測蛋白質(zhì)高分辨率結(jié)構(gòu)的成本。??