一種蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方法及裝置
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202011585063.X | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開（公告）號(hào) | CN112289370B | 公開（公告）日 | 2021-03-23 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN112289370B | 申請(qǐng)公布日 | 2021-03-23 |
| 分類號(hào) | G16B15/00(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I;G06N3/04(2006.01)I | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 華權(quán)高;趙海義;舒芹 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 武漢金開瑞生物工程有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 武漢藍(lán)寶石專利代理事務(wù)所（特殊普通合伙） | 代理人 | 劉璐 |
| 地址 | 430000湖北省武漢市東湖開發(fā)區(qū)高新大道666號(hào)武漢國(guó)家生物產(chǎn)業(yè)基地項(xiàng)目B、C、D區(qū)研發(fā)樓B1樓 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明涉及一種基于多任務(wù)時(shí)域卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方法及裝置，其方法包括：獲取目的基因序列，以及蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)；根據(jù)遺傳密碼表和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)建立每個(gè)蛋白質(zhì)對(duì)應(yīng)的DNA?RNA?氨基酸三元序列數(shù)據(jù)集；根據(jù)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中的氨基酸的殘基深度、物理化學(xué)性質(zhì)建立多元回歸方程，得到每個(gè)蛋白質(zhì)的統(tǒng)計(jì)深度特征；將所述三元序列數(shù)據(jù)集進(jìn)行聚類并映射為多維特征向量；將所述多維特征向量、蛋白質(zhì)的統(tǒng)計(jì)深度特征作為多任務(wù)時(shí)域卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的輸入，訓(xùn)練所述多任務(wù)時(shí)域卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)；利用蛋白質(zhì)的統(tǒng)計(jì)深度特征預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。本發(fā)明將蛋白質(zhì)的統(tǒng)計(jì)深度特征與多任務(wù)時(shí)域卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)合，減少模型的復(fù)雜度，提高了泛化性、擬合度。?? |
