一種基于半監(jiān)督學習框架的T細胞受體序列分類方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010291254.9 申請日 -
公開（公告）號 CN111489792A 公開（公告）日 2020-08-04
申請公布號 CN111489792A 申請公布日 2020-08-04
分類號 G16B40/20(2019.01)I;G06K9/62(2006.01)I 分類 -
發(fā)明人 王嘉寅;邊浩東;易鑫;張選平;王科;劉濤 申請（專利權(quán)）人 北京吉因加科技有限公司
代理機構(gòu) 西安通大專利代理有限責任公司 代理人 西安交通大學;北京吉因加科技有限公司
地址 710049陜西省西安市咸寧西路28號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于半監(jiān)督學習框架的T細胞受體序列分類方法，選取CDR3β區(qū)域作為輸入數(shù)據(jù)，對T細胞受體數(shù)據(jù)進行特征編碼；根據(jù)得到的數(shù)據(jù)，選擇支持向量機、隨機森林和決策樹的監(jiān)督學習算法分別構(gòu)造初始分類器C1、C2、C3；對初始分類器C1、C2、C3進行訓練得到擴充的新訓練集，產(chǎn)生的訓練集進行可重復取樣獲得三個有標記訓練集，然后從每個新訓練集產(chǎn)生一個分類器，對分類器進行迭代更新；訓練完成后，將三個分類器C1、C2、C3通過投票機制作為一個分類器集成進行使用。本發(fā)明適用于T細胞受體序列數(shù)據(jù)難以獲得的情況，性能顯著優(yōu)于現(xiàn)有方法。??