一種基于DNA測序數(shù)據(jù)的同源重組缺陷判定方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010270712.0 申請日 -
公開(公告)號 CN111462823A 公開(公告)日 2020-07-28
申請公布號 CN111462823A 申請公布日 2020-07-28
分類號 G16B40/20(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I 分類 -
發(fā)明人 趙仲孟;戴道成;易鑫;易玉婷;管彥芳;王嘉寅;張選平 申請(專利權(quán))人 北京吉因加科技有限公司
代理機構(gòu) 西安通大專利代理有限責(zé)任公司 代理人 西安交通大學(xué);北京吉因加科技有限公司
地址 710049陜西省西安市咸寧西路28號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于DNA測序數(shù)據(jù)的同源重組缺陷判定方法,獲取特征屬性;提取有效數(shù)據(jù);基于三重學(xué)習(xí)法框架,考慮到較好的泛化能力、較高的準(zhǔn)確度和對多維特征屬性的處理效率,選擇三個不同的基分類器H1、H2、H3;對H1、H2、H3進行迭代訓(xùn)練得到擴充訓(xùn)練集,由此對模型進行更新,完成訓(xùn)練過程;使用所訓(xùn)練的模型對未標(biāo)記樣本集U進行標(biāo)記,根據(jù)標(biāo)記結(jié)果完成HRD狀態(tài)的判定。本發(fā)明解決了使用單一或少量基因組不穩(wěn)定性狀態(tài)等局部特征來進行HRD狀態(tài)判定的局限性,克服臨床上已知HRD狀態(tài)的樣本數(shù)量極少的難點,實現(xiàn)已有樣本數(shù)據(jù)下的多特征屬性的學(xué)習(xí),能夠提高HRD判定方法的性能。??