用于檢測(cè)腫瘤突變負(fù)荷的序列組合和其設(shè)計(jì)方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201811303219.3 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN109427412B 公開（公告）日 2022-02-15
申請(qǐng)公布號(hào) CN109427412B 申請(qǐng)公布日 2022-02-15
分類號(hào) G16B20/00（2019.01）I;G16B25/00（2019.01）I;CN 103218543 A,2013.07.24;CN 106480205 A,2017.03.08;CN 108470114 A,2018.08.31;CN 108588194 A,2018.09.28;CN 108009400 A,2018.05.08 陳實(shí)富.循環(huán)腫瘤DNA測(cè)序的數(shù)據(jù)分析方法.《中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù)》.2018,（第02期）,摘要、第15、19、44、45、46頁(yè).;Ferga C.Gleeson等.Somatic STK11 and Concomitant STK11/KRAS Mutational Frequency in Stage IV lung Adenocarcinoma Adrenal Metastases.《J Thorac Oncol》.2015,第531-534頁(yè). 分類 物理
發(fā)明人 易玉婷;管彥芳;田超;易鑫;楊玲 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 北京吉因加科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京匯知杰知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 蔡倫;楊巍
地址 102206北京市昌平區(qū)回龍觀鎮(zhèn)中關(guān)村生命科學(xué)園北大醫(yī)療產(chǎn)業(yè)園6號(hào)樓9層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了用于檢測(cè)腫瘤突變負(fù)荷的序列組合和其設(shè)計(jì)方法。所述方法包括：a）確定需要設(shè)計(jì)探針的目標(biāo)區(qū)域，并獲得包含大樣本測(cè)定的腫瘤突變數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫(kù)；b）對(duì)于每個(gè)目標(biāo)區(qū)域，以一個(gè)窗口長(zhǎng)度進(jìn)行滑動(dòng)獲得多個(gè)窗口，對(duì)所述每個(gè)窗口進(jìn)行打分；c）對(duì)于每個(gè)目標(biāo)區(qū)域，得分最高的窗口是目標(biāo)探針區(qū)域。本發(fā)明還公開了計(jì)算組織和血漿樣本TMB的方法，以及計(jì)算組織和血漿樣本TMB的質(zhì)控方法。