利用高通量測序數(shù)據(jù)分析基因融合的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201810062150.3 申請日 -
公開（公告）號 CN108304693B 公開（公告）日 2022-02-25
申請公布號 CN108304693B 申請公布日 2022-02-25
分類號 G16B30/10（2019.01）I;G16B20/00（2019.01）I 分類 計算；推算；計數(shù);
發(fā)明人 張思文;田埂;梁羽 申請（專利權）人 元碼基因科技（北京）股份有限公司
代理機構 北京科石知識產(chǎn)權代理有限公司 代理人 高元吉
地址 100102北京市朝陽區(qū)廣順北大街5號融創(chuàng)動力A區(qū)4層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開一種利用高通量測序數(shù)據(jù)分析基因融合的方法。本發(fā)明使用pair?end數(shù)據(jù)作為輸入，對soft?clip功能不作要求，而且不必需要設置多個復雜參數(shù)，根據(jù)比對信息和后續(xù)過濾條件，檢測融合并保留融合的序列和位置，對于單端數(shù)據(jù)量1G的雙端測序數(shù)據(jù)來說，單對融合基因的分析僅需不到一小時，且每增加一對融合基因的分析，僅需增加5至10分鐘。