用于二代測(cè)序微衛(wèi)星不穩(wěn)定位點(diǎn)檢測(cè)的探針組、系統(tǒng)、檢測(cè)方法及其應(yīng)用

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202210062950.1 申請(qǐng)日 -
公開(公告)號(hào) CN114085912A 公開(公告)日 2022-02-25
申請(qǐng)公布號(hào) CN114085912A 申請(qǐng)公布日 2022-02-25
分類號(hào) C12Q1/6886(2018.01)I;C12Q1/6869(2018.01)I;C12N15/11(2006.01)I 分類 生物化學(xué);啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物學(xué);酶學(xué);突變或遺傳工程;
發(fā)明人 孫雪;趙穎;王偉偉;楊洲;張吉娜;田埂 申請(qǐng)(專利權(quán))人 元碼基因科技(北京)股份有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京北匯律師事務(wù)所 代理人 李英杰
地址 100102北京市朝陽(yáng)區(qū)廣順北大街5號(hào)融創(chuàng)動(dòng)力產(chǎn)業(yè)園A棟4層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開用于二代測(cè)序微衛(wèi)星不穩(wěn)定位點(diǎn)檢測(cè)的探針組、系統(tǒng)、檢測(cè)方法及其應(yīng)用,該方法包括:選擇至少一個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)作為靶標(biāo);設(shè)計(jì)針對(duì)靶標(biāo)的探針組,該探針組包括針對(duì)至少一個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的側(cè)翼探針,側(cè)翼探針覆蓋至少一個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)序列的側(cè)翼序列;利用探針組捕獲目標(biāo)序列。本發(fā)明的側(cè)翼探針與常規(guī)野生型探針相比不僅能夠有效避開GC異常的區(qū)域,而且能夠有效彌補(bǔ)丟失的有效測(cè)序讀段,進(jìn)而顯著提高微衛(wèi)星位點(diǎn)的覆蓋度。此外,本發(fā)明獨(dú)特的探針設(shè)計(jì)能夠大大提高靶點(diǎn)的捕獲效率,提高探針的特異性和GC均一性。因此,本發(fā)明的探針組、系統(tǒng)、檢測(cè)方法在癌癥相關(guān)微衛(wèi)星檢測(cè)中具有較高的檢測(cè)價(jià)值以及臨床價(jià)值和廣闊的應(yīng)用前景。