一種檢測微小殘留病MRD的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201811549203.0 申請日 -
公開（公告）號 CN109680062A 公開（公告）日 2019-04-26
申請公布號 CN109680062A 申請公布日 2019-04-26
分類號 C12Q1/6886（2018.01）I; C12N15/11（2006.01）I; C12Q1/6869（2018.01）I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 孫濤; 余瑩瑩; 張?zhí)祢?/td> 申請（專利權(quán)）人 杭州艾沐蒽生物科技有限公司
代理機構(gòu) 北京中政聯(lián)科專利代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 杭州艾沐蒽生物科技有限公司
地址 310058 浙江省杭州市西湖區(qū)余杭塘路浙江大學(xué)紫金港校區(qū)納米樓231室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種基于高通量測序研發(fā)的淋系血液癌癥如T/B系白血病、淋巴瘤、骨髓瘤微小殘留病的檢測方法，該方法通過添加內(nèi)參及House Keeping基因，采用帶有UMB(Unique Molecular Barcode,單分子標(biāo)簽)的多重PCR引物組對樣本分別進(jìn)行IGH(VDJ)、IGH(DJ)、IGK、IGL、TCRβ、TCRγ、TCRδ、BCL1/IGH、BCL2/IGH的文庫構(gòu)建，將所得的DNA文庫通過Illumina HiSeq平臺進(jìn)行測序，并通過生物信息學(xué)分析高通量測序結(jié)果。本方法在檢測癌細(xì)胞的同時可發(fā)現(xiàn)新突變的癌細(xì)胞，并應(yīng)用高通量測序技術(shù)結(jié)合生物信息學(xué)分析，MRD的檢測靈敏度至少可在100萬個細(xì)胞中檢測到一個癌細(xì)胞，即10?6(0.0001％)。本方法不僅可以定量分析癌細(xì)胞數(shù)量，達(dá)到微小殘留病檢測目的，而且可以糾正PCR擴增產(chǎn)生的堿基錯配導(dǎo)致的序列突變和文庫測序過程中產(chǎn)生的序列讀取錯誤。