一種基于宏基因組學(xué)的病原微生物檢測(cè)方法及裝置

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202111291817.5 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)（公告）號(hào) CN113744807B 公開(kāi)（公告）日 2022-03-11
申請(qǐng)公布號(hào) CN113744807B 申請(qǐng)公布日 2022-03-11
分類(lèi)號(hào) G16B30/10（2019.01）I;G16B30/20（2019.01）I 分類(lèi) 物理
發(fā)明人 蓋偉;李瑞琳;關(guān)尚京 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 杭州蕭山微巖醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京集佳知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 張影
地址 100176北京市大興區(qū)北京經(jīng)濟(jì)技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)經(jīng)海四路156號(hào)院11號(hào)樓2層A區(qū)001室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開(kāi)了一種基于宏基因組學(xué)的病原微生物檢測(cè)方法及裝置，包括：獲取待檢測(cè)樣本的宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)；對(duì)宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理，得到目標(biāo)數(shù)據(jù)；對(duì)目標(biāo)數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選，得到目標(biāo)序列；對(duì)目標(biāo)序列進(jìn)行聚類(lèi)分析，獲得待測(cè)樣本的候選物種類(lèi)別；將目標(biāo)數(shù)據(jù)與非冗余參考基因集進(jìn)行比對(duì)，并計(jì)算每個(gè)基因在單個(gè)樣本中的豐度，得到待測(cè)樣本的目標(biāo)物種分類(lèi)信息；將目標(biāo)數(shù)據(jù)與病原微生物可檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)中的信息進(jìn)行比對(duì)，獲得待測(cè)樣本的耐藥基因和毒性元件信息；將目標(biāo)物種分類(lèi)信息、耐藥基因和毒性元件信息，確定為待檢測(cè)樣本的檢測(cè)結(jié)果。本發(fā)明提升了病原微生物檢測(cè)適用性范圍和病原檢測(cè)準(zhǔn)確性。