一種功能性肽的篩選方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202210060585.0 申請日 -
公開（公告）號(hào) CN114420200A 公開（公告）日 2022-04-29
申請公布號(hào) CN114420200A 申請公布日 2022-04-29
分類號(hào) G16B15/30（2019.01）I;G16B20/00（2019.01）I;G16B40/00（2019.01）I;G16B50/00（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 劉會(huì)平;蔣澤根;樂國偉;施用暉 申請（專利權(quán)）人 時(shí)代生物科技（深圳）有限公司
代理機(jī)構(gòu) 深圳市精英專利事務(wù)所 代理人 譚穗平
地址 518000廣東省深圳市龍崗區(qū)橫崗街道大康社區(qū)山子下路2號(hào)東?？萍脊I(yè)園3號(hào)、4號(hào)廠房
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開一種功能性肽的篩選方法，該法低成本、高效環(huán)保，具體為：調(diào)用與所需篩選的功能性肽的功能類型相關(guān)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)；找出與功能類型相關(guān)的第一基因靶點(diǎn)集合；對已測序的各個(gè)肽段進(jìn)行功能靶點(diǎn)預(yù)測，篩選得到與功能類型相關(guān)的第二基因靶點(diǎn)集合；將第二基因靶點(diǎn)集合與第一基因靶點(diǎn)集合進(jìn)行關(guān)聯(lián)處理得到功能靶點(diǎn)；根據(jù)功能靶點(diǎn)，構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)，進(jìn)行節(jié)點(diǎn)圖可視化分析，獲得基因互作網(wǎng)絡(luò)圖，識(shí)別得到核心模塊和關(guān)鍵基因；利用R語言計(jì)算蛋白、基因的節(jié)點(diǎn)邊數(shù)，歸一化處理后獲得功能靶點(diǎn)中各個(gè)靶點(diǎn)的第一得分；單個(gè)肽段的各個(gè)靶點(diǎn)的第一得分分別乘以對應(yīng)的相似系數(shù)后求和，即為該單個(gè)肽的功能得分；選取排名前20的且疏水性0～3的肽段作為候選肽。