一種分子標(biāo)志物腫瘤缺失突變負(fù)荷的檢測(cè)方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202010971654.4 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)（公告）號(hào) CN111933219B 公開(kāi)（公告）日 2021-06-08
申請(qǐng)公布號(hào) CN111933219B 申請(qǐng)公布日 2021-06-08
分類號(hào) G16B30/10;G16B20/50;C12Q1/6886;C12Q1/6869 分類 物理
發(fā)明人 孫大偉;辛琳;承康平;蔡麗麗;段小紅;梁占超;王東亮 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 北京求臻醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司
代理機(jī)構(gòu) 重慶百潤(rùn)洪知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 姚瓊斯
地址 100000 北京市大興區(qū)經(jīng)濟(jì)技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)經(jīng)海四路156號(hào)院3號(hào)樓3層301
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及生物醫(yī)學(xué)技術(shù)領(lǐng)域，特別涉及一種分子標(biāo)志物腫瘤缺失突變負(fù)荷的檢測(cè)方法；包括以下步驟：S1：采集腫瘤患者的樣本；S2：利用探針捕獲或者擴(kuò)增子技術(shù)進(jìn)行針對(duì)人類基因組目標(biāo)區(qū)域的富集；S3：對(duì)人基因組中與腫瘤發(fā)生發(fā)展相關(guān)的特定目標(biāo)基因區(qū)域進(jìn)行測(cè)序；S4：針對(duì)所有捕獲區(qū)域，使用生物信息算法，經(jīng)過(guò)樣本數(shù)據(jù)質(zhì)控、低質(zhì)量數(shù)據(jù)過(guò)濾、比對(duì)參考基因組、變異檢測(cè)、變異過(guò)濾以及變異注釋后，獲得TDB數(shù)值。本發(fā)明提供了一種全新的TDB的計(jì)算機(jī)算法，其中TDB與微衛(wèi)星不穩(wěn)定性（Microsatellite Instability，MSI）金標(biāo)準(zhǔn)的檢測(cè)結(jié)果一致性顯著高于TMB與MSI檢測(cè)結(jié)果的一致性，可以更好地預(yù)測(cè)免疫治療療效。