一種基于新冠病毒的全基因組全長擴增的三代建庫測序方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010536120.9 申請日 -
公開（公告）號 CN111621599A 公開（公告）日 2020-09-04
申請公布號 CN111621599A 申請公布日 2020-09-04
分類號 C12Q1/70(2006.01)I 分類 生物化學；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學；酶學；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 方濤 申請（專利權）人 武漢菲沙基因信息有限公司
代理機構 上海精晟知識產(chǎn)權代理有限公司 代理人 武漢菲沙基因信息有限公司
地址 430000湖北省武漢市東湖高新技術開發(fā)區(qū)高新大道666號武漢國家生物產(chǎn)業(yè)基地項目B、C、D區(qū)研發(fā)樓B1棟
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于新冠病毒的全基因組全長擴增的三代建庫測序方法，步驟包括：1)根據(jù)新冠病毒基因組一致性序列設計與合成引物；2)新冠病毒基因組全長擴增；3)全基因組擴增子樣本混樣；4)文庫構建；5)三代測序。本發(fā)明通過結合奇數(shù)、偶數(shù)引物分別擴增，然后將奇數(shù)和偶數(shù)擴增片段進行混合，可獲得覆蓋整個新冠病毒基因組的擴增子片段，從而僅需要2個擴增反應，極大地提高了實驗效率。另外通過PacBio建庫流程，在擴增子的兩端添加帶有barcode的測序接頭，即可進行PacBio測序，通過拆分與數(shù)據(jù)校正后獲得準確率在99％以上的HiFiReads。??