適用于PacBio平臺(tái)的全長(zhǎng)擴(kuò)增子快速建庫(kù)方法、引物及測(cè)序方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202010274612.5 申請(qǐng)日 -
公開(公告)號(hào) CN111455023A 公開(公告)日 2020-07-28
申請(qǐng)公布號(hào) CN111455023A 申請(qǐng)公布日 2020-07-28
分類號(hào) C12Q1/6806(2018.01)I 分類 生物化學(xué);啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物學(xué);酶學(xué);突變或遺傳工程;
發(fā)明人 方濤 申請(qǐng)(專利權(quán))人 武漢菲沙基因信息有限公司
代理機(jī)構(gòu) 上海精晟知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 武漢菲沙基因信息有限公司
地址 430000湖北省武漢市東湖高新技術(shù)開發(fā)區(qū)高新大道666號(hào)武漢國(guó)家生物產(chǎn)業(yè)基地項(xiàng)目B、C、D區(qū)研發(fā)樓B1棟
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及一種適用于PacBio平臺(tái)的全長(zhǎng)擴(kuò)增子快速建庫(kù)方法、引物及基于該建庫(kù)方法的全長(zhǎng)擴(kuò)增子測(cè)序方法。本發(fā)明針對(duì)全長(zhǎng)擴(kuò)增子測(cè)序需要進(jìn)行PCR的特性,結(jié)合PacBio測(cè)序平臺(tái)的啞鈴型文庫(kù)接頭結(jié)構(gòu),設(shè)計(jì)了具有通用結(jié)合序列的擴(kuò)增子引物、具有與通用結(jié)合序列匹配的啞鈴型引物,并基于這兩種特殊結(jié)構(gòu)的引物提出一種適用于PacBio平臺(tái)的全長(zhǎng)擴(kuò)增子快速建庫(kù)方法,通過(guò)該方法建庫(kù),僅需在進(jìn)行常規(guī)擴(kuò)增后增加2個(gè)循環(huán)的環(huán)形引物擴(kuò)增,即可實(shí)現(xiàn)測(cè)序接頭的添加,同時(shí),通過(guò)損傷修復(fù)酶的作用,使PCR產(chǎn)物成為適用于PacBio測(cè)序平臺(tái)的標(biāo)準(zhǔn)文庫(kù)。該方法將原有的PacBio標(biāo)準(zhǔn)建庫(kù)流程優(yōu)化為僅需一步擴(kuò)增與修復(fù),極大的簡(jiǎn)化了全長(zhǎng)擴(kuò)增子的文庫(kù)構(gòu)建流程,顯著降低了測(cè)序成本。??