一種基于新冠病毒特異性逆轉(zhuǎn)錄引物的建庫(kù)方法及運(yùn)用
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202010537252.3 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN111647644A | 公開(kāi)（公告）日 | 2020-09-11 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN111647644A | 申請(qǐng)公布日 | 2020-09-11 |
| 分類號(hào) | C12Q1/6806(2018.01)I | 分類 | 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程; |
| 發(fā)明人 | 方濤 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 武漢菲沙基因信息有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 上海精晟知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 | 代理人 | 武漢菲沙基因信息有限公司 |
| 地址 | 430000湖北省武漢市東湖高新技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)高新大道666號(hào)武漢國(guó)家生物產(chǎn)業(yè)基地項(xiàng)目B、C、D區(qū)研發(fā)樓B1棟 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明公開(kāi)了一種基于新冠病毒特異性逆轉(zhuǎn)錄引物的建庫(kù)方法，其步驟包括：1)基于新冠病毒一致性序列設(shè)計(jì)15條特異性逆轉(zhuǎn)錄引物；2)基于Tn5VR轉(zhuǎn)座酶對(duì)新冠病毒建庫(kù)測(cè)序。本發(fā)明另外還公開(kāi)了該建庫(kù)方法的運(yùn)用。本發(fā)明針對(duì)新冠病毒的高保守區(qū)域設(shè)計(jì)特異性逆轉(zhuǎn)錄引物，選擇性的逆轉(zhuǎn)錄新冠病毒的RNA，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)病毒RNA的特異性富集，提高測(cè)序數(shù)據(jù)中病毒序列的占比。同時(shí)，本發(fā)明采用特異性的轉(zhuǎn)座酶建庫(kù)方法，該轉(zhuǎn)座酶僅可切割DNA與RNA雜合鏈，并在切割位置添加接頭序列，實(shí)現(xiàn)直接從DNA?RNA雜合鏈起始的建庫(kù)測(cè)序方法，可以避免存在的基因組DNA污染，同時(shí)可以將建庫(kù)的起始量量降低至1ng以下，實(shí)現(xiàn)超微量的新冠病毒測(cè)序。?? |
