一種基于新冠病毒特異性逆轉(zhuǎn)錄引物的建庫方法及運用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010537252.3 申請日 -
公開（公告）號 CN111647644A 公開（公告）日 2020-09-11
申請公布號 CN111647644A 申請公布日 2020-09-11
分類號 C12Q1/6806(2018.01)I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 方濤 申請（專利權(quán)）人 武漢菲沙基因信息有限公司
代理機構(gòu) 上海精晟知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 武漢菲沙基因信息有限公司
地址 430000湖北省武漢市東湖高新技術(shù)開發(fā)區(qū)高新大道666號武漢國家生物產(chǎn)業(yè)基地項目B、C、D區(qū)研發(fā)樓B1棟
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于新冠病毒特異性逆轉(zhuǎn)錄引物的建庫方法，其步驟包括：1)基于新冠病毒一致性序列設(shè)計15條特異性逆轉(zhuǎn)錄引物；2)基于Tn5VR轉(zhuǎn)座酶對新冠病毒建庫測序。本發(fā)明另外還公開了該建庫方法的運用。本發(fā)明針對新冠病毒的高保守區(qū)域設(shè)計特異性逆轉(zhuǎn)錄引物，選擇性的逆轉(zhuǎn)錄新冠病毒的RNA，從而實現(xiàn)對病毒RNA的特異性富集，提高測序數(shù)據(jù)中病毒序列的占比。同時，本發(fā)明采用特異性的轉(zhuǎn)座酶建庫方法，該轉(zhuǎn)座酶僅可切割DNA與RNA雜合鏈，并在切割位置添加接頭序列，實現(xiàn)直接從DNA?RNA雜合鏈起始的建庫測序方法，可以避免存在的基因組DNA污染，同時可以將建庫的起始量量降低至1ng以下，實現(xiàn)超微量的新冠病毒測序。??