一對(duì)HLA等位基因中兩個(gè)等位基因表達(dá)量的定量檢測(cè)方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202010501363.9 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開（公告）號(hào) | CN111607640A | 公開（公告）日 | 2020-09-01 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN111607640A | 申請(qǐng)公布日 | 2020-09-01 |
| 分類號(hào) | C12Q1/6881(2018.01)I;C12Q1/6851(2018.01)I | 分類 | 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程; |
| 發(fā)明人 | 李叢;周一鳴 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 角井（北京）生物技術(shù)有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 北京漢鼎理利專利代理事務(wù)所（特殊普通合伙） | 代理人 | 北京新抗元生物技術(shù)有限公司 |
| 地址 | 102206北京市昌平區(qū)科技園區(qū)生命園路29號(hào)1幢B316-12室 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供一對(duì)HLA等位基因中兩個(gè)等位基因表達(dá)量的定量檢測(cè)方法，所述方法應(yīng)用于二倍體生物中個(gè)性化HLA的檢測(cè)，所述檢測(cè)方法包括將所述測(cè)序數(shù)據(jù)的reads的長(zhǎng)度作為需要構(gòu)建的Kmer長(zhǎng)度m，分別得到每個(gè)等位基因的所有Kmer，過濾掉每個(gè)等位基因中非特有的Kmer，得到一對(duì)HLA等位基因中每個(gè)等位基因特有的Kmer，和統(tǒng)計(jì)一對(duì)HLA等位基因中兩個(gè)等位基因中每個(gè)等位基因特有的reads數(shù)量，得到該對(duì)HLA等位基因中兩個(gè)等位基因表達(dá)量及其表達(dá)的比例。?? |
