一對HLA等位基因中兩個等位基因表達量的定量檢測方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010501363.9 申請日 -
公開（公告）號 CN111607640A 公開（公告）日 2020-09-01
申請公布號 CN111607640A 申請公布日 2020-09-01
分類號 C12Q1/6881(2018.01)I;C12Q1/6851(2018.01)I 分類 生物化學；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學；酶學；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 李叢;周一鳴 申請（專利權）人 角井（北京）生物技術有限公司
代理機構 北京漢鼎理利專利代理事務所（特殊普通合伙） 代理人 北京新抗元生物技術有限公司
地址 102206北京市昌平區(qū)科技園區(qū)生命園路29號1幢B316-12室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一對HLA等位基因中兩個等位基因表達量的定量檢測方法，所述方法應用于二倍體生物中個性化HLA的檢測，所述檢測方法包括將所述測序數(shù)據(jù)的reads的長度作為需要構建的Kmer長度m，分別得到每個等位基因的所有Kmer，過濾掉每個等位基因中非特有的Kmer，得到一對HLA等位基因中每個等位基因特有的Kmer，和統(tǒng)計一對HLA等位基因中兩個等位基因中每個等位基因特有的reads數(shù)量，得到該對HLA等位基因中兩個等位基因表達量及其表達的比例。??