一種使用高通量DNA雜交芯片的人類Y染色體SNP分型方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201810686653.8 申請日 -
公開（公告）號 CN108841968A 公開（公告）日 2018-11-20
申請公布號 CN108841968A 申請公布日 2018-11-20
分類號 C12Q1/6888;C12Q1/6837;C12Q1/6858 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 陳寧;王翠紅;梁冰冰;趙南 申請（專利權(quán)）人 北京水母科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) - 代理人 -
地址 100176 北京市大興區(qū)經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū)科創(chuàng)十三街18號院8號樓402-B
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種使用高通量DNA雜交芯片的人類Y染色體SNP分型方法，基于Y染色體SNP檢測需求，進(jìn)行位點(diǎn)同源性比對，同時對比數(shù)據(jù)庫中已驗(yàn)證位點(diǎn)；根據(jù)設(shè)計好的芯片進(jìn)行生產(chǎn)；將從受試者處采集的唾液或口腔拭子樣本進(jìn)行g(shù)DNA的提?。桓鶕?jù)Axiom芯片檢測流程，自動化進(jìn)行芯片制備；使用GeneTitan MC儀器對制備好的基因芯片進(jìn)行掃描；使用軟件對基因芯片掃描結(jié)果進(jìn)行分析，計算各檢測SNP位點(diǎn)的基因型；基于檢測得到的SNP分型結(jié)果，根據(jù)ISOGG Y?DNA樹計算Y?DNA單倍群。本發(fā)明雜交SNP芯片在Y染色體的應(yīng)用具有核酸制備、檢測成本低，SNP定制位點(diǎn)靈活，測出率高，降低了原有對家族、姓氏等研究中由于改姓、入贅等帶來的結(jié)果的不確定性，實(shí)驗(yàn)檢測所需的gDNA量較低，檢測成本更低。