一種基于納米孔測序儀的高精度快速測序平臺及其搭建方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110636773.9 申請日 -
公開（公告）號 CN113570495A 公開（公告）日 2021-10-29
申請公布號 CN113570495A 申請公布日 2021-10-29
分類號 G06T1/20（2006.01）I;G06F8/71（2018.01）I;G06F8/65（2018.01）I;G06F8/61（2018.01）I;G16B30/00（2019.01）I 分類 計算；推算；計數(shù);
發(fā)明人 谷紅倉;徐振宇;王云飛;車仙榮 申請（專利權(quán)）人 杭州圣庭醫(yī)療科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 杭州華鼎知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 魏亮
地址 311113浙江省杭州市余杭區(qū)良渚街道通運(yùn)街362號11幢301室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于納米孔測序儀的高精度快速測序平臺及其搭建方法，屬于分子生物領(lǐng)域，搭建測序平臺方法包括：測序平臺硬件設(shè)備，測序平臺軟件安裝，測序平臺系統(tǒng)配置；硬件設(shè)備包括：CPU，GPU，SSD；測序平臺軟件包括：ubuntu 18.04 LTS，CUDA，GUPPY，MinKNOW；測序平臺系統(tǒng)配置包括：配置CUDA環(huán)境變量，配置MinKNOW運(yùn)行參數(shù)，配置GUPPY和配置軟件自動升級；本發(fā)明通過硬件的選取和測序軟件環(huán)境整合解決了現(xiàn)有技術(shù)中三代Nanopore測序堿基判讀耗時長且準(zhǔn)確度不高的問題，具有廣泛的臨床潛力。