一種基于Nanopore測(cè)序儀進(jìn)行結(jié)核分枝桿菌耐藥檢測(cè)分析系統(tǒng)及其構(gòu)建方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202110673816.0 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN113674801A 公開（公告）日 2021-11-19
申請(qǐng)公布號(hào) CN113674801A 申請(qǐng)公布日 2021-11-19
分類號(hào) G16B20/50（2019.01）I;G16B30/10（2019.01）I;G16B40/00（2019.01）I;G16B50/10（2019.01）I;G16B50/30（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 谷紅倉(cāng);謝長(zhǎng)校;徐振宇;王云飛;車仙榮 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 杭州圣庭醫(yī)療科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 杭州華鼎知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 魏亮
地址 311113浙江省杭州市余杭區(qū)良渚街道通運(yùn)街362號(hào)11幢301室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于Nanopore測(cè)序儀進(jìn)行結(jié)核分枝桿菌耐藥檢測(cè)分析系統(tǒng)及其構(gòu)建方法，屬于基因檢測(cè)分析領(lǐng)域，系統(tǒng)包括：微生物序列參考庫(kù)模塊、結(jié)核分枝桿菌耐藥參考庫(kù)模塊、病原微生物鑒定模塊、突變檢測(cè)模塊和耐藥數(shù)據(jù)庫(kù)注釋模塊；基于該系統(tǒng)的構(gòu)建方法包括：構(gòu)建數(shù)據(jù)比對(duì)的微生物序列參考庫(kù)，將測(cè)序數(shù)據(jù)比對(duì)到微生物序列參考庫(kù)并鑒定病原微生物，構(gòu)建用于突變注釋的結(jié)核分枝桿菌耐藥參考庫(kù)，將來源于結(jié)核分枝桿菌的序列比對(duì)到結(jié)核分枝桿菌參考基因組并鑒定基因突變，將結(jié)核分枝桿菌的基因突變位點(diǎn)與結(jié)核分枝桿菌耐藥參考庫(kù)關(guān)聯(lián)分析突變位點(diǎn)的耐藥性質(zhì)；本系統(tǒng)能夠快速鑒定病原微生物和檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌耐藥性質(zhì)，且靈敏度和特異性高。