一種基于納米孔測序儀的分枝桿菌快速鑒定方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110836894.8 申請日 -
公開（公告）號 CN113667728A 公開（公告）日 2021-11-19
申請公布號 CN113667728A 申請公布日 2021-11-19
分類號 C12Q1/6869（2018.01）I;C12Q1/689（2018.01）I;C12Q1/04（2006.01）I;C12N15/11（2006.01）I;C12R1/32（2006.01）N 分類 生物化學；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學；酶學；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 谷紅倉;陶春豪;許佩松;王云飛;車仙榮 申請（專利權(quán)）人 杭州圣庭醫(yī)療科技有限公司
代理機構(gòu) 杭州華鼎知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 魏亮
地址 311113浙江省杭州市余杭區(qū)良渚街道通運街362號11幢301室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于納米孔測序儀的分枝桿菌快速鑒定方法，屬于分子生物學領(lǐng)域，本發(fā)明包括如下步驟：步驟一，設(shè)計結(jié)核分枝桿菌插入序列IS6110、hsp65、rpoB、16S rRNA、gyrB基因待測區(qū)域的特異性引物；步驟二，得到含有特定堿基序列的引物并混合形成引物池；步驟三，合成Barcode引物；步驟四，提取基因組DNA；步驟五，第一輪擴增并純化；步驟六，第二輪擴增并純化；步驟七，構(gòu)建測序文庫并純化；步驟八，使用納米測序儀測序，對數(shù)據(jù)進行質(zhì)控分析后，進行數(shù)據(jù)分析；本發(fā)明通過找到這5種靶基因組合的擴增引物，使擴增序列能對分枝桿菌不同菌種進行鑒定區(qū)分，實現(xiàn)快速、準確、靈敏的鑒定分歧桿菌。