一種基于納米孔測(cè)序儀的結(jié)核分枝桿菌耐藥型鑒定方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202110836869.X 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)（公告）號(hào) CN113493848A 公開(kāi)（公告）日 2021-10-12
申請(qǐng)公布號(hào) CN113493848A 申請(qǐng)公布日 2021-10-12
分類號(hào) C12Q1/689（2018.01）I;C12Q1/6858（2018.01）I;C12Q1/04（2006.01）I;C12N15/11（2006.01）I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 谷紅倉(cāng);陶春豪;許佩松;王云飛;車仙榮 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 杭州圣庭醫(yī)療科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 杭州華鼎知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 魏亮
地址 311113浙江省杭州市余杭區(qū)良渚街道通運(yùn)街362號(hào)11幢301室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開(kāi)了一種基于納米孔測(cè)序儀的結(jié)核分枝桿菌耐藥型鑒定方法，包括如下步驟：步驟一，結(jié)核分枝桿菌插耐藥相關(guān)基因rpoB、katG、?15 inhA、pncA、embB、rpsL、gyrA、gyrB的特異性引物；步驟二，得到8對(duì)含有特定堿基序列的引物，再混合形成引物池；步驟三，合成barcode引物；步驟四，提取基因組DNA；步驟五，第一輪擴(kuò)增并純化；步驟六，第二輪擴(kuò)增；步驟七，構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)并純化；步驟八，使用納米測(cè)序儀測(cè)序，對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)控分析后，進(jìn)行數(shù)據(jù)分析；屬于分子生物學(xué)領(lǐng)域，采用本發(fā)明的方法能夠得知6種臨床常見(jiàn)抗結(jié)核藥物的耐藥突變情況，檢測(cè)快速、準(zhǔn)確、全面。