一種基于matK基因的未知植物物種識別數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建方法及數(shù)據(jù)庫

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010319607.1 申請日 -
公開（公告）號 CN111681704B 公開（公告）日 2022-06-17
申請公布號 CN111681704B 申請公布日 2022-06-17
分類號 G16B20/00（2019.01）I;G06K9/62（2022.01）I;G16B50/00（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 寧康;白虹;楊朋碩;盧璟詳;鄒欣桐;李洪軍 申請（專利權(quán)）人 華中科技大學(xué)鄂州工業(yè)技術(shù)研究院
代理機(jī)構(gòu) 北京眾達(dá)德權(quán)知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 -
地址 436044湖北省鄂州市梧桐湖新區(qū)鳳凰大道特一號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 一種基于matk基因的未知植物物種識別數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建方法及數(shù)據(jù)庫，所述方法包括步驟：獲取含有matk基因的原始序列數(shù)據(jù)文件；提取所述原始序列數(shù)據(jù)文件中的物種注釋信息；將所述物種注釋信息整合至所述matK基因上，以得到matK序列；對所述matk序列進(jìn)行質(zhì)量控制；根據(jù)所述matk序列之間的相似性進(jìn)行聚類；根據(jù)聚類結(jié)果構(gòu)建所述數(shù)據(jù)庫。本申請?zhí)峁┑囊环N基于matk基因的未知植物物種識別數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建方法及數(shù)據(jù)庫優(yōu)點(diǎn)為：（1）檢測通量高；（2）高靈敏度和選擇性；（3）該方法所構(gòu)建的數(shù)據(jù)庫覆蓋面廣、數(shù)據(jù)質(zhì)量高、信息全面；（4）可以利用生物信息學(xué)方法在物種的水平上確定未知物種。