一種檢測細菌16S rDNA全長的建庫測序方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910790501.7 申請日 -
公開(公告)號 CN110452974A 公開(公告)日 2019-11-15
申請公布號 CN110452974A 申請公布日 2019-11-15
分類號 C12Q1/6869;C12Q1/04;C40B50/06;G16B30/10 分類 生物化學;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物學;酶學;突變或遺傳工程;
發(fā)明人 馮濤;馬偉志;王震 申請(專利權(quán))人 北京群峰納源健康科技有限公司
代理機構(gòu) 北京棧橋知識產(chǎn)權(quán)代理事務所(普通合伙) 代理人 北京群峰納源健康科技有限公司
地址 102209北京市昌平區(qū)北七家鎮(zhèn)未來科學城南區(qū)四路科研樓4層A-03室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種檢測細菌16S rDNA全長的建庫測序方法,通過在每個樣品上加上分子標簽UMI,分別擴增得到連接文庫和拼接文庫,對兩個文庫進行測序,通過識別UMI組合的方式提取數(shù)據(jù),并組裝出16S rDNA全長序列,進而比對數(shù)據(jù)庫確定菌種種類。本發(fā)明的建庫方法適合所有類型樣本的菌群結(jié)構(gòu)檢測,能夠?qū)鹘y(tǒng)的菌群結(jié)構(gòu)鑒定從“屬”級別提升到“種”級別,與屬水平相比較,種水平的優(yōu)勢,可以更準確的確定環(huán)境微生物的生態(tài)結(jié)構(gòu),便于深入研究,由此可對樣本進行特定細菌菌種的檢測。