基于多模態(tài)深度編碼的HLA抗原呈遞預(yù)測方法和系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202111205908.2 申請日 -
公開(公告)號 CN113807468A 公開(公告)日 2021-12-17
申請公布號 CN113807468A 申請公布日 2021-12-17
分類號 G06K9/62(2006.01)I;G06N3/04(2006.01)I;G06Q10/04(2012.01)I;G16B30/10(2019.01)I;G06N3/08(2006.01)I 分類 計(jì)算;推算;計(jì)數(shù);
發(fā)明人 方榯楷;費(fèi)才溢;徐實(shí) 申請(專利權(quán))人 南京澄實(shí)生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 南京天華專利代理有限責(zé)任公司 代理人 劉暢;傅婷婷
地址 210000江蘇省南京市江北新區(qū)探秘路73號樹屋十六棟D-2棟2層209室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于多模態(tài)深度編碼的HLA抗原呈遞預(yù)測方法,包括:1)采用多種不同的深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)來編碼已知序列信息2)引入已有的文獻(xiàn)與計(jì)算工具計(jì)算親和力指數(shù)3)多模態(tài)特征融合得到預(yù)測分?jǐn)?shù)并進(jìn)行預(yù)測。不同于以往的僅基于生物實(shí)驗(yàn)或親和力指數(shù)預(yù)測的方法,本系統(tǒng)方案能高效地融合多模態(tài)信息,進(jìn)行更加準(zhǔn)確高效的預(yù)測。且在處理不同方法負(fù)樣本,處理數(shù)據(jù)不平衡的模塊上有靈活的拓展性,能夠更好適應(yīng)真實(shí)的藥物研發(fā)生產(chǎn)環(huán)境。