基于多模態(tài)深度編碼的抗原免疫原性預(yù)測方法和系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202111204465.5 申請日 -
公開（公告）號 CN113762416A 公開（公告）日 2021-12-07
申請公布號 CN113762416A 申請公布日 2021-12-07
分類號 G06K9/62（2006.01）I;G06N3/04（2006.01）I;G06N3/08（2006.01）I;G16B30/10（2019.01）I 分類 計算；推算；計數(shù);
發(fā)明人 費才溢;徐實 申請（專利權(quán)）人 南京澄實生物科技有限公司
代理機構(gòu) 南京天華專利代理有限責(zé)任公司 代理人 劉暢;傅婷婷
地址 210000江蘇省南京市江北新區(qū)探秘路73號樹屋十六棟D-2棟2層209室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于多模態(tài)深度編碼的抗原免疫原性預(yù)測方法和系統(tǒng)，包括：1）包含較全面HLA等位基因個數(shù)；2）可變長肽段編碼方式，涵蓋主要HLA?I結(jié)合肽段長度；3）考慮抗原受體譜系對肽段免疫原性的影響；4）包含肽段和MHC序列的物理和氨基酸組成特征；5）多模態(tài)特征融合得到預(yù)測分數(shù)并進行預(yù)測。不同于以往的僅基于生物實驗或較單一化的數(shù)據(jù)模態(tài)的預(yù)測模型，本系統(tǒng)方案能高效地融合多模態(tài)信息，進行更加準確高效的預(yù)測。基于真實數(shù)據(jù)結(jié)果表面，其TOP?10結(jié)果具有較高水平的PPV值，能夠更好的應(yīng)用在真實的藥物研發(fā)生產(chǎn)環(huán)境。