一種基于二代測序的微單倍型檢測分型系統(tǒng)和方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110128303.1 申請日 -
公開（公告）號 CN112885407A 公開（公告）日 2021-06-01
申請公布號 CN112885407A 申請公布日 2021-06-01
分類號 G16B20/20;G16B30/00;G16B40/30 分類 物理
發(fā)明人 錢剛;韓斐然;戴凡;劉歆;陳云;閻敏 申請（專利權(quán)）人 杭州聯(lián)川基因診斷技術(shù)有限公司
代理機構(gòu) 杭州信義達專利代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 萬景旺
地址 310000 浙江省杭州市杭州經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)6號大街260號6幢一層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于二代測序的微單倍型檢測分型系統(tǒng)和方法，屬于生物信息學技術(shù)領(lǐng)域。所述系統(tǒng)包括：數(shù)據(jù)輸入模塊、數(shù)據(jù)庫存儲模塊、MHParser分型模塊、MHParser樣本相似度計算模塊，還可包括MHParser多序列比對模塊和MHParser樣本聚類模塊。所述方法包括：獲得檢測位點列表和樣本二代測序比對文件；利用檢測位點列表，根據(jù)樣本二代測序比對文件計算微單倍型位點，得到微單倍型分型結(jié)果；計算任意兩個樣本之間的相似性分值。利用本發(fā)明，可以準確獲得任意兩個樣本之間的相似度，簡單可靠，進一步，還可通過多序列比對和聚類分析，對樣本進行識別，排除樣本混淆和污染問題，進一步提高比對的準確性，具有重要的應(yīng)用價值。