基于Sanger測序的HLA分型方法及設(shè)備

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202011600233.7 申請日 -
公開（公告）號 CN112669903A 公開（公告）日 2021-04-16
申請公布號 CN112669903A 申請公布日 2021-04-16
分類號 G16B20/30 分類 物理
發(fā)明人 郭同壘;何勝;劉明坤;葉鋒 申請（專利權(quán)）人 北京旌準(zhǔn)醫(yī)療科技有限公司
代理機構(gòu) 北京細軟智谷知識產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司 代理人 付登云
地址 102600 北京市大興區(qū)北京經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)經(jīng)海四路156號院14號樓4層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本申請涉及一種基于Sanger測序的HLA分型方法及設(shè)備，包括：獲取待識別基因的測序數(shù)據(jù)；根據(jù)待識別基因的測序數(shù)據(jù)，基于預(yù)先訓(xùn)練的堿基識別模型，得到待識別基因各位點的正確堿基信號；判讀所述待識別基因的核酸序列并與參考序列比對獲得差異位點，基于預(yù)先整理的等位基因型與所述差異位點，采用位運算比較獲得HLA分型結(jié)果。由于堿基識別模型以非正常堿基的測序數(shù)據(jù)作為樣本數(shù)據(jù)進行訓(xùn)練，訓(xùn)練得到的堿基識別模型可以對Sanger測序數(shù)據(jù)中存在的低質(zhì)量、雜合堿基和污染信號等非正常堿基進行識別，使用位運算快速獲得等位基因型分型結(jié)果，解決了人工進行識別速度慢、準(zhǔn)確性低的問題。