一種鑒別東北地區(qū)黃芩的SSR分子標(biāo)記引物及方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202011048452.9 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)(公告)號(hào) CN113684291A 公開(kāi)(公告)日 2021-11-23
申請(qǐng)公布號(hào) CN113684291A 申請(qǐng)公布日 2021-11-23
分類(lèi)號(hào) C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 分類(lèi) 生物化學(xué);啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物學(xué);酶學(xué);突變或遺傳工程;
發(fā)明人 王繼永;鄭司浩;曾燕;劉美娟;尚興樸;梁煥;趙莎;王浩;李九如;高強(qiáng);靜一;劉國(guó)城;孫文靜 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人 深圳華大基因科技服務(wù)有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京知聯(lián)天下知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 代理人 張陸軍;張迎新
地址 100195 北京市海淀區(qū)西四環(huán)北路15號(hào)依斯特大廈8層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種鑒別東北地區(qū)黃芩的SSR分子標(biāo)記引物及方法,方法包括如下步驟:以待鑒定黃芩樣本的總DNA為模板,用SSR分子標(biāo)記引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到擴(kuò)增產(chǎn)物;對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行毛細(xì)管電泳測(cè)序分型,得到擴(kuò)增產(chǎn)物的分型結(jié)果;將擴(kuò)增產(chǎn)物的分型結(jié)果用GeneMarker4.0進(jìn)行峰圖判讀,得到等位基因矩陣;根據(jù)等位基因矩陣,通過(guò)GenALEx計(jì)算黃芩的遺傳多樣性數(shù)據(jù);基于GenALEx計(jì)算所得的遺傳多樣性數(shù)據(jù),通過(guò)MEGA進(jìn)行UPGMA聚類(lèi)分析,構(gòu)建聚類(lèi)樹(shù)。本發(fā)明應(yīng)用基因組技術(shù)及SSR分子標(biāo)記技術(shù),利用黃芩基因組設(shè)計(jì)SSR引物,并通過(guò)河北、山西、山東、陜西、內(nèi)蒙古、遼寧、吉林等地的黃芩樣本篩選SSR引物,用于特異性鑒別東北地區(qū)黃芩樣本,準(zhǔn)確度高、穩(wěn)定性強(qiáng)、易于大范圍推廣應(yīng)用。