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中國科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所（XINJIANG INSTITUTE OF ECOLOGY AND GEOGRAPHY，CHINESE ACADEMY OF SCIENCES）成立于1998年7月7日，由中國科學(xué)院新疆生物土壤沙漠研究所（1961年成立）和中國科學(xué)院新疆地理研究所（1965年成立）合并而成。 研究所重點培養(yǎng)新疆城鎮(zhèn)生態(tài)建設(shè)與工礦區(qū)生態(tài)修復(fù)、干旱區(qū)污染修復(fù)與廢棄物利用、干旱區(qū)生物多樣性保育與流域生態(tài)農(nóng)業(yè)模式、特殊功能基因發(fā)掘與新品種培育、新疆自然災(zāi)害預(yù)警與應(yīng)急管理五個研究方向。 截至2014年底，研究所共有在職職工445人；建有1個國家重點實驗室，1個中科院重點實驗室；1個國家研究中心，1個中科院研究中心。